北京農(nóng)學(xué)院植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院教授秦嶺、邢宇團(tuán)隊(duì)通過全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)對板栗6個(gè)產(chǎn)量相關(guān)的園藝性狀進(jìn)行分析,揭示了板栗果實(shí)相關(guān)產(chǎn)量性狀的遺傳基礎(chǔ),為板栗育種提供了有價(jià)值的信息和見解。日前,相關(guān)研究發(fā)表在《植物生理》上。

板栗樣品。課題組供圖

板栗。課題組供圖
板栗是重要的木本糧食作物,由于其較高的營養(yǎng)價(jià)值和對貧瘠土壤的耐受性,在山區(qū)廣泛種植。近年來對板栗的研究主要集中在性狀相關(guān)性分析、分子標(biāo)記開發(fā)以及對栗疫病的抗性方面,缺少與產(chǎn)量直接相關(guān)的性狀(種子大小)和間接相關(guān)性狀(葉片長度)的遺傳結(jié)構(gòu)分析和基因功能的驗(yàn)證。近年來,課題組公布了板栗第一個(gè)基因組,構(gòu)建了板栗愈傷瞬時(shí)轉(zhuǎn)化體系,為實(shí)現(xiàn)基因功能的快速鑒定奠定基礎(chǔ)。
本研究廣泛收集了151份中國板栗品種(系),并對其進(jìn)行簡化基因組測序。群體遺傳學(xué)結(jié)果表明,中國板栗品種可分為南北兩個(gè)生態(tài)型。通過對兩種生態(tài)型群體全基因組水平受選擇信號分析,鑒定到可能影響板栗性狀和環(huán)境適應(yīng)性的串聯(lián)排列基因。為進(jìn)一步探究板栗產(chǎn)量相關(guān)性狀形成,對151個(gè)品種(系)的6個(gè)重要園藝性狀進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)研究。鑒定出45個(gè)高度相關(guān)的QTL,篩選出6個(gè)與這些性狀高度相關(guān)的基因,包括影響板栗單粒重的候選基因CmAP2和葉長的候選基因CmCIB1。利用基因沉默和過表達(dá)技術(shù)對其進(jìn)行功能驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)CmAP2通過負(fù)調(diào)控細(xì)胞大小影響種子大小,CmCIB1則是通過影響細(xì)胞的長度影響葉片和新梢的長度。
據(jù)悉,秦嶺和邢宇為論文通訊作者,北京農(nóng)學(xué)院和北京林業(yè)大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)博士生張煜、北京農(nóng)學(xué)院博士張偉偉和劉陽為論文第一作者。
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