孫宏賀，男，2005年畢業(yè)于南開(kāi)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物科學(xué)專(zhuān)業(yè)，2006至2009年在北京華大基因、北京基因組研究所參加工作，從事微生物基因組相關(guān)生物信息分析工作，2010年開(kāi)始在北京農(nóng)學(xué)院植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院攻讀蔬菜學(xué)碩士研究生，于2013年6月畢業(yè)并取得碩士學(xué)位，期間（2012年6月至2013年3月）作為交流學(xué)生在美國(guó)康奈爾大學(xué)BTI植物研究所費(fèi)章君博士實(shí)驗(yàn)室研修，學(xué)習(xí)生物信息學(xué)分析，具有生物學(xué)、農(nóng)學(xué)（蔬菜學(xué)）和生物信息學(xué)的跨學(xué)科背景。碩士在讀期間相關(guān)課程成績(jī)優(yōu)秀，學(xué)位課平均成績(jī)班級(jí)第一，碩士畢業(yè)論文被推薦為北京農(nóng)學(xué)院優(yōu)秀畢業(yè)論文。

在即將碩士畢業(yè)之際，我校研究生孫宏賀在《自然·遺傳學(xué)》上作為并列第一作者發(fā)表了論文《Thedraft genome of watermelon ( Citrulluslanatus) and resequencing of 20 diverseaccessions》，影響因子高達(dá)35.5。在微觀而充滿(mǎn)神秘的生物學(xué)研究領(lǐng)域中，孫宏賀帶著執(zhí)著的信念和兢兢業(yè)業(yè)的態(tài)度不斷努力著，將自己的青春和熱情譜寫(xiě)在基因圖譜中，他說(shuō)如今的一點(diǎn)成績(jī)是為了更好地開(kāi)始，他將繼續(xù)帶著“行中思、思中行”的理念不斷前行。

穩(wěn)扎穩(wěn)打  萬(wàn)丈高樓平地起

本科畢業(yè)后的孫宏賀先后在北京華大基因及北京基因組研究所工作，從事以第一代測(cè)序技術(shù)為基礎(chǔ)的生物信息學(xué)分析。平日里的孫宏賀不怕麻煩，以做研究的態(tài)度對(duì)待工作，在學(xué)會(huì)如何實(shí)現(xiàn)一個(gè)分析方法的同時(shí)，還要探究方法原理，弄清楚為什么這個(gè)分析應(yīng)該如此實(shí)現(xiàn)。經(jīng)過(guò)對(duì)組裝及基因注釋等生物信息學(xué)分析的深入研究，他熟悉地掌握了Sanger測(cè)序技術(shù)相關(guān)的數(shù)據(jù)分析方法，這為他之后的科研工作奠定了扎實(shí)的基礎(chǔ)。

為了應(yīng)對(duì)科學(xué)技術(shù)和實(shí)驗(yàn)方法的快速更新?lián)Q代，孫宏賀不斷給自己充電，2012年他前往美國(guó)康奈爾大學(xué)交流學(xué)習(xí)，在不斷的探索學(xué)習(xí)后，掌握了基于下一代測(cè)序(NGS)數(shù)據(jù)的生物信息分析方法，不僅能熟練完成基因組從頭組裝、轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)基因分析、基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)遺傳差異比較分析等序列分析工作，還能夠應(yīng)用R語(yǔ)言進(jìn)行相關(guān)生物統(tǒng)計(jì)分析工作，同時(shí)接觸了一部分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建工作內(nèi)容。在關(guān)注手頭分析工作的同時(shí)，孫宏賀也盡量利用良好的學(xué)術(shù)環(huán)境，參與學(xué)習(xí)學(xué)術(shù)講座，了解同事的研究?jī)?nèi)容，通過(guò)借鑒別人的研究成果和經(jīng)驗(yàn)來(lái)拓寬視野、解放思維。回國(guó)后，他不僅將先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)應(yīng)用到科研創(chuàng)新中，還將“思中行、行中思”的理念帶到研究中去，為一些問(wèn)題的解決提供切實(shí)可行的方法。

從無(wú)到有  第一張西瓜基因組序列的問(wèn)世

生物信息學(xué)是孫宏賀擅長(zhǎng)的領(lǐng)域，它是從海量數(shù)據(jù)中挖掘生物學(xué)意義的必要支撐。隨著大量基因信息產(chǎn)出的積累，系統(tǒng)、規(guī)模化的基因研究能夠?yàn)榫植康木?xì)研究指引方向，快速確定出少量、可靠的候選研究對(duì)象，節(jié)省局部研究工作量，為全基因組水平提供研究依據(jù)。在基因組學(xué)研究的重心由基因組的結(jié)構(gòu)向基因的功能轉(zhuǎn)移的后基因組時(shí)代中，生物信息學(xué)起著至關(guān)重要的作用。

在北京農(nóng)學(xué)院攻讀碩士學(xué)位的日子里，孫宏賀主要的研究方向是西瓜等蔬菜作物的生物信息學(xué)分析，這個(gè)工作繁雜而困難，但經(jīng)過(guò)孫宏賀的努力鉆研，他成功地為西瓜全基因組精細(xì)圖譜繪制、西瓜基因組進(jìn)化分析提供了生物信息學(xué)分析支持，并作為西瓜基因組論文的并列第一作者在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)刊物《自然·遺傳學(xué)》上發(fā)表專(zhuān)業(yè)論文，影響因子高達(dá)35.5。

精誠(chéng)合作  一個(gè)好漢三個(gè)幫

整個(gè)西瓜基因組計(jì)劃研究項(xiàng)目由許勇老師帶領(lǐng)，在多名研究人員共同參與下完成。孫宏賀所在的整個(gè)團(tuán)隊(duì)分工明確，互幫互助。項(xiàng)目首先由許老師以及其他幾位老師一起完成文章的整體設(shè)計(jì)，再將具體研究?jī)?nèi)容細(xì)致劃分成很多部分，包括基因組的測(cè)序組裝注釋、進(jìn)化以及重測(cè)序分析、RNA-Seq數(shù)據(jù)分析、果實(shí)品質(zhì)性狀分析、抗病基因分析、果實(shí)發(fā)育分析等等。接下來(lái)根據(jù)個(gè)人擅長(zhǎng)領(lǐng)域分配任務(wù)，孫宏賀就負(fù)責(zé)其中的組裝評(píng)價(jià)、進(jìn)化相關(guān)分析以及品質(zhì)性狀的相關(guān)分析。

在休息時(shí)間，團(tuán)隊(duì)的組員會(huì)將各自的研究進(jìn)展進(jìn)行交流，為其他研究者的實(shí)驗(yàn)提供可靠的數(shù)據(jù)來(lái)源和理論支持。每個(gè)人都將自己的熱情與精力投入到這場(chǎng)“戰(zhàn)爭(zhēng)”中去。經(jīng)過(guò)大家的不懈努力，付出得到了回報(bào)。他們不僅得到了西瓜基因組高質(zhì)量的序列圖譜，還通過(guò)與包含野生變種在內(nèi)的20個(gè)西瓜種質(zhì)資源重測(cè)序數(shù)據(jù)的比較，鑒別出在馴化過(guò)程中受到強(qiáng)烈選擇的基因組區(qū)域，這些區(qū)域與果實(shí)顏色、風(fēng)味以及果實(shí)大小等經(jīng)濟(jì)性狀有關(guān)，為后續(xù)的基因定位提供線(xiàn)索。同時(shí)發(fā)現(xiàn)部分疾病抗性基因在馴化中丟失，這為西瓜抗病研究提供參考，有很大的經(jīng)濟(jì)適用價(jià)值和生物學(xué)意義，為后續(xù)的進(jìn)一步發(fā)展指明方向。

寧?kù)o致遠(yuǎn)  做生活和理想的主宰者

每個(gè)實(shí)驗(yàn)的成功都是建立在無(wú)數(shù)次失敗之上，實(shí)驗(yàn)初期由于孫宏賀對(duì)組裝工作了解不夠，而學(xué)術(shù)上需要對(duì)組裝結(jié)果做一個(gè)質(zhì)量評(píng)估。這使孫宏賀犯了難，于是他決定“取經(jīng)”，他立馬起身前往深圳學(xué)習(xí)了一個(gè)多月，同時(shí)參考當(dāng)時(shí)發(fā)表的可可基因組文章，最后給出了一個(gè)可行的評(píng)估方式和結(jié)果。

面對(duì)從未接觸過(guò)的重測(cè)序數(shù)據(jù)多樣性的分析，孫宏賀也采取同樣的方法，不過(guò)這次他先從網(wǎng)上查閱相關(guān)的基本理論，查完網(wǎng)絡(luò)信息后，再翻看文獻(xiàn)，看前人是怎么使用的，為此許老師還專(zhuān)門(mén)帶他去中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)向賴(lài)錦勝老師請(qǐng)教，在邊學(xué)邊做、邊做邊學(xué)中摸索過(guò)來(lái)。

“對(duì)于做科研來(lái)說(shuō)，有了新的分析需求之后，去找參考文獻(xiàn)，了解原理，實(shí)現(xiàn)分析，這個(gè)過(guò)程是必不可少的階段，同時(shí)也是它的魅力所在。解決問(wèn)題的辦法只有與人交流，不斷努力，不斷提高。”孫宏賀說(shuō)，“哪里不會(huì)就多向人請(qǐng)教，哪里不如人就少睡覺(jué)，總有超越別人的一天。”簡(jiǎn)單樸實(shí)的話(huà)中卻道出了研究者對(duì)待科研持之以恒的精神。

對(duì)于孫宏賀來(lái)說(shuō)，他之前的歲月幾乎都是在校園中度過(guò)，“我想做科研，但還必須養(yǎng)家糊口吃飽飯，后一樣是責(zé)任，不能放下，前一樣是理想，不想放下，唯一的辦法就是靜下心來(lái)把科研工作做好。”他這樣評(píng)價(jià)自己的生活和理想。他知道，這兩者在他的生命中同等重要，缺一不可，如果想要兩者同樣出色，那么就需要用自己的出色交換，付出加倍的努力。面對(duì)現(xiàn)在大學(xué)生普遍存在的浮躁現(xiàn)象，他給出了簡(jiǎn)單而堅(jiān)定的回答：“寧?kù)o方可致遠(yuǎn)”。未來(lái)科研和生活的路上，他將繼續(xù)帶著“行中思、思中行”的理念不斷前行。